Фамилия Стоянков — редкий случай, когда географический след просматривается почти безошибочно. Её основа — болгарское личное имя Стоян, которое происходит от глагола «стоя» (стоять) и означает «стойкий», «устойчивый», «постоянный». В Болгарии это имя было распространено повсеместно, а вот в русской среде фамилии на -ков от болгарских имён — редкость. Стоянковы, скорее всего, потомки болгар, переселившихся на территорию Российской империи в XVIII–XIX веках. Самый известный поток таких мигрантов — болгарские колонисты, которых после русско-турецких войн селили в Бессарабии, в Одесской и Херсонской губерниях, а также в Крыму. Там и могла осесть семья, взявшая фамилию по имени родоначальника.

Суффикс -ов в фамилии Стоянков — стандартный русский патронимический показатель, который «пришили» к болгарской основе при адаптации. В самой Болгарии фамилия звучала бы как Стоянов, но на русской почве, под влиянием местной модели, к основе добавили -ков, что встречается у фамилий, образованных от имён на -ян: ср. Аваков, Акопян → Акопов. Получается, что Стоянков — это «сын Стояна» по-русски, но с болгарским корнем. В документах XIX века можно встретить и вариант Стоянковъ, а в советское время написание закрепилось без твёрдого знака.

Интересно, что в русских говорах слово «стоянка» или «стоян» могло означать постоялый двор или место для остановки, но фамилия Стоянков вряд ли связана с этим значением. Если бы корень был русским, мы бы увидели фамилии Стоянов или Стоянинов, а суффикс -к- в данном случае — не уменьшительный, а часть болгарского имени. Поэтому версия о прозвище по профессии (например, «стоянщик» — хозяин постоялого двора) отпадает: слишком много косвенных признаков указывает на болгарское происхождение.

По данным современных телефонных справочников, Стоянковы встречаются в основном на юге России и в Украине — в Краснодарском крае, Ростовской области, в Одессе и Кишинёве. Это косвенно подтверждает гипотезу о миграции болгарских поселенцев. Среди носителей фамилии нет громких исторических фигур, но в среде потомков болгарских колонистов фамилия держится стабильно, не смешиваясь с русскими однокоренными вариантами. Так что, если вы Стоянков, ваши предки почти наверняка говорили на болгарском языке и пришли на территорию России не случайно, а в составе организованного переселения.