Фамилия Стынко — один из примеров, где ключ к происхождению лежит не в славянском, а в румынском или молдавском языке. В отличие от большинства русских фамилий на -ко, которые часто образованы от уменьшительных форм крестильных имён (Иванко, Петрусько), основа здесь — слово «стын» (stîn, stân). В молдавском и румынском это означает «скала», «утес», «камень». Соответственно, Стынко — это «камешек», «скальный» или «каменистый». Прямой параллелью будет украинская фамилия Каменюк или польская Камёнка.

Такая модель характерна для западно- и южнорусских земель, но особенно для Бессарабии, Подолья и Буковины — регионов, где веками пересекались славянские и романские диалекты. Фамилия Стынко могла возникнуть как прозвище человека, жившего на каменистой почве, либо как указание на его крепость и несгибаемость — «твёрдый как камень». Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с диалектным глаголом «стынуть» (замерзать, остывать) — тогда Стынко могло быть прозвищем медлительного или холодного по характеру человека. Однако первая версия убедительнее, поскольку слово «стын» в значении «скала» зафиксировано в говорах Молдовы и Приднестровья.

Суффикс -ко в данном случае выполняет не столько уменьшительную, сколько идентифицирующую функцию — он типичен для украинских и молдавских фамилий, оформляя прозвище в фамилию. Встречается также вариант написания Стынка, что указывает на ту же основу, но с иным грамматическим родом в исходном прозвище.

По сословной принадлежности носители фамилии Стынко чаще всего были крестьянами или мещанами из западных губерний Российской империи. В метрических книгах XIX века фамилия встречается в Херсонской, Подольской и Бессарабской губерниях. Стынко — редкая фамилия, не входящая в сотни самых распространённых, и её носители до сих пор компактно проживают на юге Украины и в Молдове.