Фамилия Субботовский — яркий пример того, как географическая привязка и религиозная или бытовая традиция могли слиться в одной фамильной модели. Вопреки возможному предположению, что корень «суббот» указывает на день недели, здесь скорее всего речь о топониме, то есть о названии населённого пункта.

Основа фамилии — «Субботов» или «Суббота». Суффикс «-овский» (а также его вариант «-евский») типичен для польской и западнорусской шляхетской традиции. Он указывает на происхождение из места, которое называлось Субботово, Субботов или просто Суббота. Такие названия встречались на территории бывшей Речи Посполитой и в Малороссии (ныне Украина). Самый известный пример — село Субботов (Черкасская область), родина Богдана Хмельницкого. Житель этого села или выходец оттуда получал прозвание Субботовский — «тот, кто из Субботова».

Однако не стоит исключать и вторую, менее очевидную версию. В древнерусской и западнорусской ономастике было распространено некалендарное имя Суббота (или Субботка). Его давали ребёнку, родившемуся в этот день недели, или, по народным поверьям, чтобы защитить от сглаза. От этого имени образовалась фамилия Субботин, а вот Субботовский могла возникнуть как патронимическая (по отцу) или как прозвищная, если человек был известен как «Субботов сын» или «Субботов человек». Но суффикс «-ский» всё же сильнее тянет к шляхетскому, «земельному» значению, поэтому версия с местом рождения выглядит убедительнее.

С точки зрения словообразования, фамилия редкая по модели: если Субботиных в России много, то Субботовских — единицы. Это говорит о том, что фамилия не была массовой крестьянской, а скорее принадлежала к слою мелкой шляхты или казачьей старшины, которые часто брали фамилии по названию своего хутора или усадьбы. В современном русском языке фамилия звучит как типичная польская или украинская фамилия на «-ский», что нередко указывало на более высокий социальный статус предка по сравнению с соседями-однодворцами.

Таким образом, Субботовский — это человек, чей предок либо владел землёй или жил в месте с «субботним» названием, либо был назван в честь дня своего появления на свет, но с оговоркой, что в таком случае фамилия скорее приняла бы форму Субботин. География фамилии (юго-западные регионы) склоняет к первой, топонимической версии.