Фамилия Субботинский образована от аналогичного прозвища, которое ведет свое начало от топонима Субботинское, Субботино. Так называются сельские поселения, расположенные в Курганской области и Красноярском крае, а также село – в Самарской области. Вполне вероятно, что родоначальник Субботниских родился или долгое время жил в одном из этих населенных пунктов. Скорее всего, название этих селений восходит к мирскому имени первого поселенца – Суббота. Очевидно, что это имя связано с названием шестого дня недели «суббота», ведущего начало от еврейского сллова «шаббат», «саббат» - «день покоя». Возможно, что основатель данных поселений появился на свет именно в этот день.