Фамилия Субботина образована от нецерковного имени Суббота, которое давали человеку, появившемуся на свет в шестой день недели. В старину это было распространённой практикой: имя давали не по святым, а по обстоятельствам рождения, и Суббота — один из ярких примеров такого мирского имени. Оно восходит к еврейскому «шаббат», что значит «день покоя», но в крестьянской среде этот библейский смысл почти стёрся — имя просто фиксировало день недели, как, скажем, Неделя или Пятница.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Субботина буквально значит «дочь или жена Субботы». Такая модель типична для фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на -а, и она же роднит Субботину с целым пластом русских фамилий вроде Никитина или Фомина. Мужской вариант, Субботин, встречается заметно чаще, но женская форма сохранила ту же основу и тот же смысл.

Есть и другая версия, которую иногда приводят исследователи: прозвище Суббота могли дать не родившемуся в этот день, а человеку, чем-то напоминавшему окружающим сам день недели — например, медлительному или, наоборот, тому, кто соблюдал особый порядок. Однако эта гипотеза слабее: слишком уж устойчиво в ономастике связаны подобные имена именно с днём рождения. Так что основная версия остаётся самой правдоподобной.

Интересно, что в некоторых говорах слово «суббота» имело и дополнительный оттенок — так могли назвать банный день или поминальный обряд. Но для фамилии это скорее побочная линия: если бы прозвище пошло от обряда, мы бы ждали других суффиксов и форм. Здесь же всё указывает на прямое имя.

Потомки человека по имени Суббота со временем получили фамилию Субботина — и в этом смысле она хранит не только семейную историю, но и бытовой календарь наших предков, где каждый день недели имел своё лицо.