Фамилия Субин ведет начало от личного прозвища Суба. Чтобы понять её значение, нужно разобраться, что стояло за этим словом. Наиболее вероятное объяснение отсылает к венгерскому слову suba — «мех», «шуба». Тогда прозвище Суба получал человек, связанный с изготовлением или продажей меховых изделий, — меховщик или шубник. Венгерских основ в русских фамилиях сравнительно немного, в отличие, например, от румынских, поэтому такая этимология выделяет фамилию на фоне других.

Но это не единственная версия. Существует гипотеза, связывающая прозвище Суба с псковским диалектным словом «субой» — «шум, возня, гомон». Если следовать ей, то Субой или Субойным могли прозвать крикливого, беспокойного человека, от которого много шума. В таком случае прозвище Суба закреплялось не за ремесленником, а за носителем определенного характера. Обе версии имеют право на существование, но первая выглядит убедительнее: связь с конкретным ремеслом — более типичная основа для прозвища, чем диалектный отголосок.

Сама модель образования фамилии проста и характерна для русского ономастикона. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Субин буквально значит «сын Субы», «тот, кто из рода Субы». Такой способ словообразования широко использовался на Руси, когда личное прозвище отца становилось основой для фамилии потомков. Прозвище Суба, каким бы ни было его происхождение, со временем закрепилось как основное именование человека, а затем перешло в фамильный суффикс.

Стоит заметить, что фамилия не слишком распространена, что тоже косвенно говорит в пользу её прозвищного, а не искусственного происхождения. Она не связана с географическими названиями или церковными именами, а потому её носители почти наверняка происходят от одного или нескольких людей, получивших такое прозвище в разных регионах. Точных исторических свидетельств о первых носителях фамилии Субин не сохранилось, поэтому мы можем судить о ней только через лингвистический анализ. Тем не менее, даже без документальных подтверждений, фамилия Субин читается достаточно ясно: за ней либо стоял мастер мехового дела, либо человек с громким голосом и живым нравом.