Фамилия Судакины принадлежит к распространённому типу русских фамилий, образованных от мирского имени. В её основе лежит личное имя Судак, которое давали ребёнку до крещения. Такие имена, как правило, были связаны с названиями животных, птиц или рыб, и Судак здесь — прямое указание на рыбу семейства окунёвых. Подобная практика была широко распространена в Древней Руси: называя младенца Судаком, родители словно вверяли его природе, надеясь, что он перенят у своего «тёзки» силу, ловкость или жизненную цепкость. Любопытно, что в новгородских берестяных грамотах, найденных археологами, упоминаются братья Линёвы, носившие имена Сом, Ерш, Окунь и Судак — это прямое свидетельство того, что подобные имена бытовали в реальной жизни, а не только в книжных преданиях.

Однако у фамилии есть и вторая версия происхождения, связанная с прозвищем. Глагол «судачить» — то есть сплетничать, болтать, перемывать косточки — мог дать прозвище Судак человеку разговорчивому или любящему посудачить. В этом случае фамилия Судакин не имеет отношения к рыбе, а отражает особенность характера предка. Обе версии имеют право на существование, но первая, «рыбная», выглядит более убедительной: она опирается на древнюю традицию мирских имён, тогда как прозвище от глагола «судачить» встречается в источниках реже и не даёт такого естественного объяснения суффиксальной модели.

Третья гипотеза связывает фамилию с топонимом Судак — приморским городом в юго-восточном Крыму, известным своими виноградниками и курортами. Если следовать этой версии, родоначальник Судакиных мог быть уроженцем этого города или долгое время жить в нём, а фамилия закрепилась за ним по месту происхождения. Этимология самого названия города неясна. По одной из версий, оно восходит к ираноязычному «сугда» — «священный», «чистый», «непорочный»; в современном осетинском языке это слово звучит как «Сыгъдæг» и употребляется в религиозных контекстах, например, Сугъдæг Уасгерги — Святой Георгий. Крымские татары, в свою очередь, объясняют название через сочетание suv — «вода» и dağ — «гора». Но эта топонимическая версия для фамилии Судакин всё же менее вероятна: фамилии от названий городов обычно образуются с суффиксом -ский (Судакский), тогда как форма Судакин указывает на личное имя или прозвище.

Словообразовательная модель фамилии проста и характерна для русского ономастикона: суффикс -ин присоединяется к основе, оканчивающейся на согласный, и указывает на принадлежность к отцу — «сын Судака». Это типичная патронимическая форма, которая закрепилась в качестве родового имени. Родственные фамилии — Судаков, Судачков, Судаковский — встречаются в русских говорах, но Судакин сохраняет более архаичный, личный оттенок.

О точном времени и месте возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, и окончательно они закрепились лишь к XVII–XVIII векам. Можно лишь предположить, что предки Судакиных жили в северных или центральных русских землях, где были распространены мирские имена от названий рыб. В любом случае, фамилия Судакин — это живое напоминание о древней традиции именования, которая связывала человека с миром природы и бытовой культурой его предков.