Фамилия Тарахтин образована от прозвища или нецерковного имени Тарахта. Её основа — звукоподражательное слово «тарахтеть», то есть издавать громкий, дробный звук, греметь, стучать. В говорах «тарахта» — человек, который говорит быстро и без умолку, тараторит, или же тот, кто суетится, создаёт много шума при работе. Прозвище давали либо болтливому, либо деятельному, но суматошному человеку, чьи действия сопровождались грохотом.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — «Тарахтин». Такая модель типична для фамилий, образованных от основ на -а, -я. В отличие от более распространённого суффикса -ов, -ин чаще встречается в северных и центральных областях России, а также в Сибири, куда переселенцы приносили свои прозвища. Географически фамилия Тарахтин нечастотна, но фиксируется в Вологодской, Архангельской губерниях и на Урале.

Словарь Б. Унбегауна относит подобные фамилии к разряду прозвищных, образованных от глагольных междометий. В данном случае основа «тарахт-» имеет параллели в тюркских языках, где тарах — звук треска, но русское происхождение прозвища более вероятно: оно встроено в ряд «барахта», «чепуха», «торопыга» с характерной экспрессивной окраской.

Встречается и вариант написания — Тарахтин, без смягчения, что подтверждает связь с твердым звукоподражанием. Однокоренные фамилии — Тарахтеев, Тарахин — но Тарахтин стоит особняком из-за редкого сочетания -хт- в корне, что делает её легко узнаваемой. Предки носителя этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, чьё прозвище закрепилось в документах XVII–XVIII веков, когда фиксация фамилий стала массовой.