Фамилия Тимофева — вариант написания, который почти всегда оказывается графической или орфографической ошибкой. В русской антропонимии, за редчайшими исключениями, существует только форма Тимофеева. Причина проста: фамилия образована от канонического мужского имени Тимофей через притяжательное прилагательное. Суффикс -ев- указывает на принадлежность: чей? — Тимофеев, то есть сын человека по имени Тимофей. Написание с одной «е» (Тимофева) противоречит стандартной словообразовательной модели, поэтому в подавляющем большинстве случаев это искажение, возникшее из-за невнимательности при заполнении документов, опечатки или реформы правописания, когда двойные гласные могли упрощать.

Если всё же допустить, что это не ошибка, а редкий исторический вариант, то его появление можно объяснить диалектными особенностями произношения. В некоторых говорах, особенно на Русском Севере или в Поволжье, безударный звук между согласными мог редуцироваться, и фамилию на слух записывали так, как слышали: «Тимофева» вместо «Тимофеева». Такие случаи единичны и не образуют устойчивой традиции. В отличие, например, от фамилий на -ин (Пушкин, Гагарин), где окончание всегда одно, фамилии на -ев в русском языке почти не допускают потери буквы без изменения рода.

Основа фамилии — имя Тимофей, которое пришло из греческого языка и означает «почитающий Бога». В святцах оно появилось рано, поэтому крестьянские и мещанские фамилии на -ев от этого имени широко распространены по всей России. Носители фамилии Тимофеев (и её редкого варианта Тимофева) могли быть потомками крестьянина или ремесленника, которого в семье звали Тимофей. Сословной привязки нет: Тимофеевы встречаются и среди дворян, и среди духовенства, и среди крепостных. Если вы встретили написание «Тимофева» в официальном документе или архиве, скорее всего, это следствие канцелярской ошибки, которую стоит исправить на нормативную форму Тимофеева.