Фамилия Тимофый — редкий случай, когда в основе лежит не каноническое церковное имя, а его просторечная, народная форма. Перед нами не Тимофеев и не Тимошин, а именно Тимофый. Исходное имя — Тимофей (от греческого «почитающий Бога»), но в русских говорах, особенно в южных и западных регионах, конечное -ей могло переходить в -ый под влиянием местного произношения. Так Тимофей становился Тимофыем, а его потомки — Тимофыями.

Словообразовательная модель здесь необычна. Фамилия застыла в форме, близкой к именительному падежу исходного прозвища или имени, и не получила типичного русского суффикса принадлежности (-ов, -ин). Это указывает на то, что фамилия могла сформироваться относительно поздно или в среде, где фамилии фиксировались «как слышатся», без книжной обработки. Встречаются фамилии такого типа в основном на территории Украины, Белоруссии и юга России — в тех краях, где аканье и яканье сильнее меняли облик имён.

По социальному происхождению носители фамилии Тимофый скорее всего относились к крестьянству или казачеству. В ревизских сказках и метрических книгах XIX века такие фамилии редко встречаются у дворян или духовенства, так как те обычно придерживались литературной нормы. Возможно, предок носителя фамилии был просто Тимофыем — человеком, которого в округе знали под этим нестандартным именем, и прозвище закрепилось за его детьми без изменений.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что Тимофый стоит особняком. Тимофеевы — самая частая и «правильная» форма, Тимохины, Тимошины — от уменьшительных вариантов. Тимофый же сохраняет полное, но искажённое звучание имени, что делает фамилию ценной для диалектологов: она фиксирует живое произношение, которое почти исчезло из письменных источников. Встретить её сегодня можно крайне редко, и каждый случай — это маленькое свидетельство местного говора и народной традиции имянаречения.