Фамилия Тимошкова — один из тех случаев, когда народная форма имени полностью вытеснила в родовом прозвании своего «официального» предка. В её основе лежит не полное каноническое имя Тимофей, а его уменьшительная, обиходная версия — Тимошка. Именно от неё и пошла фамилия, отвечая на вопрос «чей ты будешь?»: Тимошкин сын, внук или правнук со временем превратился в Тимошкова.

Само имя Тимофей пришло на Русь вместе с христианством из древнегреческого языка, где оно складывается из двух основ: «тимо» — почитать, чтить, и «феос» — бог. То есть в переводе это «почитающий бога». Однако в повседневной жизни, особенно в среде простых людей, полное имя звучало слишком торжественно. Гораздо чаще использовали короткие и ласковые формы: Тимоха, Тима, а для детей и младших по возрасту — Тимошка.

Именно эта форма — Тимошка — и стала основой фамилии. Суффикс -к-, который мы видим в исходном прозвище, был не просто уменьшительным, но и указателем на молодой возраст или невысокое социальное положение. В XVI–XVII веках так могли называть не только ребёнка, но и взрослого человека из крестьян или посадских людей, в то время как дворянина чаще величали полным именем. Поэтому, судя по словообразовательной модели, основатель рода Тимошковых с высокой долей вероятности был выходцем из рабочей, ремесленной или крестьянской среды, а не из боярской аристократии.

Интересно, что фамилия закрепилась именно в женской форме — Тимошкова. В русской традиции это не отдельная «женская» фамилия, а грамматическая форма родительного падежа, отвечающая на вопрос «чья?». Изначально так говорили о жене или дочери Тимошки: «она — Тимошкова». Позже эта форма закрепилась за всем родом, и сейчас она одинаково относится и к мужчинам, и к женщинам, хотя в мужском роде чаще пишут Тимошков.

С точки зрения географии, фамилия не привязана к какому-то одному региону — она встречается по всей центральной России и в Поволжье, что говорит о повсеместной популярности имени Тимофей среди крестьянства. Однокоренные родовые прозвания — Тимохов, Тимохин, Тимашов, Тимофеев — образованы от других производных форм того же имени, и все они восходят к одному источнику: греческому «почитающий бога». Но именно Тимошкова сохранила в себе ту самую «простонародную» интонацию, которая многое говорит о происхождении предков.