Фамилия Транкина образована от прозвища Транка через притяжательный суффикс -ин, который в русской традиции указывал на родство: Транкина буквально понималось как «дочь или жена Транка». Само прозвище Транка — это уменьшительная форма от Транк, и именно вокруг основы Транк строится большинство версий происхождения фамилии.

Самая распространённая гипотеза связывает прозвище с украинским словом «транк» — «штаны до колен». Такие штаны были популярны в эпоху Возрождения и вошли в моду во второй половине XVI века. Носителя прозвища могли так называть по двум причинам: либо он изготавливал такие штаны, либо, что забавно, продолжал их носить, когда они уже вышли из моды. Вторая версия отсылает к средненемецкому слову tranc — «пить». В этом случае Транком могли прозвать любителя хмельных напитков. Третья гипотеза, менее известная, возводит основу к румынскому tranc — «болтовня», «шум», тогда прозвище получал разговорчивый или шумный человек.

Из этих трёх версий самая правдоподобная — первая, с украинским «транком». Она конкретна и связана с материальной культурой, тогда как версия о любителе выпить слишком обща, а румынское влияние на русские прозвища менее вероятно ввиду географии. Хотя, если фамилия бытовала в юго-западных регионах, где контакт с румынским языком возможен, третья гипотеза тоже имеет право на существование.

Позже прозвище Транка, изначально присоединённое к наследственному имени, полностью заменило его и в повседневной жизни, и в официальных документах. Поскольку фамилия закрепилась в форме женского рода, можно предположить, что в документах она фиксировалась через женщину — вдову или дочь, что не редкость для ранних этапов становления русских фамилий.