Фамилия Трифоненков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Трифоненков послужило церковное имя Трифон. Мужское крестильное имя Трифон в переводе с греческого означает «нежный». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Трифон, со временем получил фамилию Трифоненков. О точном месте и времени возникновения фамилии Трифоненков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Трифоненков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.