Фамилия Трохинина — женская форма, мужской вариант — Трохинин. Её основа — имя Трохим, народная форма канонического имени Трофим. В говорах, где «ф» заменяли на «х» (явление фрикативного произношения или просто фонетического упрощения), Трофим превращался в Трохима. Такая замена характерна для южнорусских и украинских диалектов, но встречалась повсеместно в простонародной среде.

Трофим — имя греческого происхождения, означающее «кормилец», «питомец». В святцах оно было распространённым, поэтому и производных фамилий от него много: Трофимов, Трофимкин, Трохин. Трохинин стоит особняком из-за суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Трохинин, то есть сын или потомок Трохима. В отличие от фамилий на -ов (Трофимов), форма на -ин чаще закреплялась за прозвищами или именами, оканчивающимися на согласный, и была особенно типична для северных и центральных областей России.

Спорных версий здесь немного. Можно было бы предположить связь с диалектным словом «троха» (кроха, мелочь), но это маловероятно: ударение в фамилии падает на второй слог, и основа «Трох-» явно восходит к личному имени. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне Трохины и Трохинины, что подтверждает бытование уменьшительной формы Троха, Трохин.

Социально фамилия неэлитарная. Её носители — в основном крестьяне и посадские люди. В XIX веке Трохинины записаны в переписях Воронежской, Курской, Тамбовской губерний — тех самых, где имя Трохим было в ходу. Встречается фамилия и сейчас, но нечасто: по данным открытых источников, Трохининых в России около тысячи человек, большинство в Центральном Черноземье и на юге.

Итак, предок носительницы фамилии Трохинина звался Трохимом — скорее всего, был крестьянином или ремесленником, а имя ему дали в честь святого Трофима. Фамилия сохранила живую народную переделку церковного имени, что и делает её отличной от более стандартных Трофимовых.