Фамилия Трусагин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка звучало иначе, чем современная фамилия. Разберёмся по порядку.

Словообразовательная модель очевидна: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Трусагин). Основа — Трусага. Но что такое «трусага»? В современных говорах этого слова нет. Скорее всего, перед нами не прямое прозвище, а адаптированная форма. Наиболее вероятная версия: в основе лежит прозвище Трус. Однако суффикс -аг-а (как в «бедняга», «хитряга») придаёт слову оттенок пренебрежительности или, наоборот, шутливой фамильярности. То есть Трусага — это не просто «трус», а «трусишка», «трусливый человек». Фамилия Трусагин, таким образом, означает «потомок Трусаги» (то есть человека, которого за глаза называли Трусагой).

Есть и другая, менее убедительная гипотеза. В некоторых северных говорах «трус» — это не страх, а «тряска», «землетрясение» или даже «плохая дорога, где трясёт». В этом случае Трусагой могли прозвать человека суетливого, беспокойного или того, кто жил на тряской, болотистой почве. Но эта версия слабее — прозвища от абстрактных явлений встречаются реже, чем от черт характера.

Редкость фамилии (она почти не встречается за пределами нескольких областей) говорит о том, что прозвище Трусага было локальным, возможно, диалектным. В официальных документах оно могло закрепиться именно в форме с суффиксом -аг-а, который позже «обрусел» до привычного Трусагин. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог — ТрусАгин, что соответствует модели «ТрусАга — ТрусАгин».

Если ваш предок носил такую фамилию, он, вероятно, жил в центральной или северо-западной России и получил прозвище от односельчан за излишнюю осторожность или робость. Фамилия не дворянская и не купеческая — суффикс -ин типичен для крестьянской и мещанской среды.