Фамилия Трусенкин образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей: основа плюс суффикс -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Трусенкин — это «сын Трусенки» или «человек из семьи Трусенки». А вот основа Трусенк- — это уже уменьшительная форма от прозвища или имени.

Корень здесь — «трус». Казалось бы, всё очевидно: предок был трусливым человеком. Но в русских говорах у слова «трус» было и другое, не связанное с боязнью значение. В некоторых диалектах «трусой» называли мелкую рыбешку, мальков, а также крошку, пыль, труху. Кроме того, в старину «трус» означал землетрясение или сильную тряску. Поэтому прозвище Трус мог получить не робкий человек, а, например, мелкий, щуплый парень или тот, кто жил в неспокойном месте.

Форма Трусенка — это типичный для северных и центральных русских говоров уменьшительный вариант. Суффикс -енк- (как в Петренко, Феденко) в русском языке часто встречается в прозвищах и неофициальных именах. Таким образом, Трусенкин — это не сын Труса напрямую, а потомок того, кого в быту называли Трусенкой. Фамилия эта относительно редкая, её носители, скорее всего, происходят из крестьянской или мещанской среды, где прозвища были повседневной нормой.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Трусов, Трусихин, Трушкин) показывает, что Трусенкин стоит особняком: в нём нет прямого указания на качество (как в Трусове), а есть именно «семейное» прозвище, перешедшее в фамилию. В документах XVII–XVIII веков подобные формы встречаются в переписных книгах Новгородской и Вятской губерний, что может указывать на возможный ареал первоначального бытования фамилии.