Фамилия Цехоня — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет популярных суффиксов вроде -ов или -ин, а окончание -я сразу наводит на мысль о западнославянском или украинско-белорусском следе. Скорее всего, перед нами фамилия польского или южнорусского корня, образованная от прозвища.

Самая прямая версия отсылает к польскому слову cichy — «тихий, спокойный». В польском языке есть форма cichonia (род. падеж) или производное прозвище Cichonia, которое на русской почве могло адаптироваться в Цехоня через характерный переход «и» в «е» в безударной позиции. Такие прозвища давали человеку с тихим нравом, молчуну. Если это так, то фамилия — из той же группы, что и Цехов, Цихоня, Циховский, но с менее тривиальной огласовкой.

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, — связь с немецким словом Zeche («цех»). В таком случае Цехоня могло быть прозвищем цехового мастера, ремесленника, объединённого в гильдию. Однако для этого варианта фамилия должна была бы иметь суффикс -оня, характерный скорее для восточнославянских уменьшительных форм (как «Семёня» от «Семён»), а не для немецких заимствований. К тому же в русских говорах слово «цех» не дало продуктивных прозвищ на -оня.

С точки зрения географии, фамилия Цехоня встречается в основном в западных областях России (Брянская, Смоленская) и на востоке Беларуси. Это подтверждает её польско-белорусские корни. Сословно носители могли быть как крестьянами, так и мещанами — прозвище не указывает на знатность, а скорее на личную характеристику.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, Цехоня стоит особняком: у неё нет массовых аналогов, как у Цехов или Цехнович. Это говорит о том, что фамилия могла закрепиться в одном роду без широкого распространения. Единственное, что можно сказать точно: корень здесь не связан с «цехом» в современном значении, а уходит в личное прозвище.