Фамилия Цилина образована от прозвища Циля. Скорее всего, оно происходит от нарицательного «цилик», означающее в вологодских говорах «молодой гриб». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Циля, со временем получил фамилию Цилина.