Фамилия Циндрина — редкий случай, когда географический корень почти очевиден, но механизм образования нестандартен. Основа «Циндр-» с высокой вероятностью восходит к топониму Циндри, Циндра — названия населённых пунктов, встречающиеся в Латвии и Эстонии. В латышском языке «cindre» — диалектное название растения, но для фамилии первична именно географическая привязка: так могли прозвать выходца из местности Циндри или Циндра. Суффикс «-ин» здесь указывает на принадлежность: «чей?» — Циндрин, то есть «сын человека по прозвищу Циндра» или «человек из рода Циндры».

Однако есть и альтернативная версия, связанная с профессией. В некоторых русских говорах «циндрить» означало «точить, чинить, наводить остроту» — это могло относиться к точильщику ножей или инструментов. Тогда Циндра — прозвище мастера по заточке, а Циндрин — его потомок. Эта гипотеза менее распространена, но словообразовательно возможна: от глагольной основы с суффиксом -ин фамилии образовывались реже, чем от имен или прозвищ на -а.

Словообразовательная модель фамилии типична для северных и центральных областей России: «-ин» — патронимический суффикс, характерный для фамилий, образованных от основ на -а/-я. Но сама основа «Циндр-» явно не славянского происхождения, что и делает фамилию редкой. Встречается она преимущественно в Ленинградской, Псковской областях и в Прибалтике — в зоне исторического смешения балтийских и русских фамильных традиций. Носители фамилии Циндрина — это, скорее всего, потомки либо переселенцев из Прибалтики, либо ремесленников-точильщиков, осевших в русских деревнях.

В написании фамилии стоит обратить внимание на окончание: Циндрин — мужской вариант, Циндрина — женский. Форма на -а не является самостоятельной фамилией, а лишь указывает на пол носителя, что типично для русских фамилий с суффиксом -ин. Других вариантов написания (с «ы», «и» после «ц») не зафиксировано, что говорит о стабильной, неискажённой передаче корня.