Фамилия Цыпурко звучит необычно для русского уха, и это не случайно: её корни ведут на запад или юго-запад славянского мира. Перед нами типичный пример фамилии, образованной по украинской или белорусской модели с помощью суффикса -ко. Этот суффикс в восточнославянских языках — один из самых распространённых способов превратить прозвище или имя в фамилию, часто с уменьшительным или «сыновним» оттенком (как Ивашко — сын Ивана). В русской традиции фамилии на -ко обычно считаются украинскими по происхождению.

Основа фамилии — «Цыпур». Самое очевидное и правдоподобное объяснение — связь с диалектным словом «цыпурка». В украинском и южнорусских говорах так называли небольшую деревянную трубочку, мундштук для курения, а иногда — просто короткую палочку или чубук. Человек, который постоянно курил трубку или изготавливал такие мундштуки, мог получить прозвище Цыпур, а его дети становились Цыпурками. Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с глаголом «цыпать» (цеплять, хватать), что давало бы прозвище хваткому или придирчивому человеку.

В пользу первой версии говорит то, что фамилия Цыпурко встречается прежде всего в западных и центральных областях Украины, а также среди потомков переселенцев на Кубани и в Сибири. Если предок носил это прозвище, он, скорее всего, был либо мастеровым (делал трубки), либо имел заметную привычку — не расставался с курительной трубкой. В XIX веке подобные прозвища, цеплявшиеся к бытовой детали или привычке, были обычным делом, и фамилия Цыпурко — живое тому свидетельство, без всякой «благородной» подоплёки, но с ясным и узнаваемым бытовым корнем.