Фамилия Туяков — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все прочие версии. Носители фамилии встречаются в основном в двух удалённых друг от друга регионах: в Татарстане и Башкортостане, а также на юге Западной Сибири, в Кемеровской и Новосибирской областях. Этот разброс не случаен и указывает на общий корень — тюркское слово «туй» (свадьба, пир). Суффикс «-як» в тюркских языках часто образует имена деятеля или носителя признака: «туяк» — это «свадебный человек», то есть либо завсегдатай пиров, либо, что правдоподобнее, распорядитель на свадьбе, тамада. В татарской среде такое прозвище давали человеку, который славился умением вести торжество, или просто любителю погулять.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с башкирским «туяҡ» (копыто). Тогда прозвище могло относиться к человеку с крепкими, «копытными» ногами, то есть неутомимому ходоку или пастуху. Однако в фамилиях на «-яков» (Туяков, Куяков, Буяков) чаще прослеживается именно прозвищная, а не зооморфная основа: суффикс «-як» в тюркских именах указывает на характерное действие или свойство, а не на прямую аналогию с животным.

Модель образования фамилии — русская, с патронимическим суффиксом «-ов». Это значит, что предок носителя фамилии в документах XVII–XIX веков был записан как Туяк, а его дети и внуки стали Туяковыми. Фамилия не дворянская и не священническая: в метрических книгах Казанской и Уфимской губерний Туяковы числятся среди государственных крестьян и тептярей (сословие, близкое к башкирам и татарам-мишарям). В Сибирь фамилия попала, скорее всего, во время переселенческих волн конца XIX века, когда крестьяне из Поволжья осваивали алтайские и кузнецкие земли.

Ударение в фамилии, судя по региональной традиции, падает на последний слог — Туяко́в, хотя в русской литературной норме допустимо и на второй.