Основой фамилии Устинин послужило имя Устин. Имя Устиня – производная форма имени Устин, которая образована от мужского имени Юстин. Это имя ведет свое начало от латинского слова justus - «справедливый». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Устиня, со временем получил фамилию Устинин.