Фамилия Вахновецкий — это типичная «географическая» фамилия, указывающая на выходца из определённого места. Её основа — название населённого пункта, а суффикс -ецк- прямо говорит о принадлежности к местности. Человек, получавший такую фамилию, был «тем, кто из Вахновки» или «из Вахновцев».

Сам топоним восходит к прозвищу или имени Вахно. Так могли звать основателя селения. Какое имя лежит в основе — вопрос открытый. Вахно могло быть уменьшительной формой от крестильных имён Варфоломей (арамейское «сын вспаханной земли», «сын полей»), Вахтисий (персидское «счастливый») или Василий (греческое «властитель, царь»). Все три варианта возможны, но самый вероятный — от Василия, поскольку это имя было широко распространено, а форма Вахно встречается в старых документах как просторечный вариант.

Есть и другая, менее очевидная версия: прозвище Вахно могло произойти от слова «вахня» — рыба семейства тресковых. В этом случае прозвище могли дать рыбаку или человеку с какой-то внешней или поведенческой чертой, напоминавшей эту рыбу. Эта гипотеза слабее, но родственные прозвища действительно фиксируются в истории: в XVII веке встречаем томского конного казака Ивана Вахню (1649 г.), Ивашка Вахну (1684 г.) и крестьянина Митрофанка Иванова сына Вахнева (1623 г.). Все они жили на севере и востоке России, где рыбный промысел был в ходу.

Географически фамилия Вахновецкий привязана к Украине. Основные претенденты на роль исходного топонима — деревня Вахновка в Винницкой области и село Вахновцы в Хмельницкой области. Оба названия находятся на территории исторической Подолии. Модель образования фамилии через суффикс -ецкий (сравните: Звенигород → Звенигородский, Ростов → Ростовский) характерна для польской и западнорусской ономастики, что указывает на возможное влияние шляхетской традиции или, как минимум, на формирование фамилии в среде, где ценилась «географическая» идентичность.

Таким образом, Вахновецкий — это фамилия, которая прямо говорит о месте происхождения рода. Предки носителя этой фамилии, скорее всего, жили в одном из сёл с корнем «Вахн-» на западе Украины, а сама фамилия закрепилась за ними как указание на их малую родину.