Фамилия Вахрунов — классический пример «отчества второго порядка». Её основа — не имя и не прозвище, а уже готовая фамилия или прозвище Вахрун, к которой добавили типичный русский суффикс -ов, означающий «сын» или «потомок». Иными словами, Вахрунов — это «внук Вахруна» или «сын Вахрунова».

Ключевой вопрос: откуда взялось само слово Вахрун? Самый прямой путь — через народную форму крестильного имени Варфоломей. В русской традиции длинные греческие имена часто «съёживались» до двух-трёх слогов: Варфоломей превращался в Вахромей, а затем — в Вахрушку, Вахруна. Имя Варфоломей арамейского происхождения, означает «сын вспаханной земли» или «сын Толмая», но в быту оно давно утратило связь с исходным значением и стало просто личным именем. Если предок носителя фамилии был крещён как Варфоломей, а в семье его звали Вахруном, то его дети становились Вахруновыми.

Есть и вторая, менее распространённая версия — от прозвища, связанного с диалектным глаголом «вахрушить» (шуметь, ворчать, делать что-то небрежно). В некоторых говорах «вахрун» — это ворчун или неряха. Однако эта гипотеза слабее: прозвища с таким корнем редки, а имя Варфоломей в народных формах дало целое гнездо фамилий — Вахрушев, Вахрушин, Вахромов, Вахрамеев. Вахрунов стоит в этом же ряду, но с другим суффиксальным оформлением.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России — Вологодской, Архангельской, Кировской областям, а также к Уралу. Там формы имени Варфоломей вроде Вахрун и Вахрушка были особенно употребительны. Вахруновы — не дворянский род, а потомки крестьян, ремесленников или священнослужителей, в среде которых каноническое имя часто заменялось обиходным вариантом. Фамилия довольно редкая, её носители не составляли многочисленного сословия, и в дореволюционных переписях она встречается точечно, а не массово.

Таким образом, в основе фамилии Вахрунов лежит не профессия и не черта характера, а имя предка, сокращённое до домашнего прозвища. Это типичная русская фамилия, в которой слышен отголосок давно забытого церковного имени, переработанного народной речью.