Фамилия Вахрушев образована от имени Вахруша, народной формы канонического имени Варфоломей. В переводе с греческого Варфоломей означает «сын вспаханной земли» или «сын полей», но в русском быту это имя дало множество производных форм. Вахруша — одна из них, наряду с Вахрамей, Варфоломей и другими. Имя Варфоломей было популярно в крестьянской и купеческой среде, и его просторечные варианты закрепились в фамилиях. В народе бытовала присказка: «Вахрамей, разумей: кого корят, а тебе в глаза говоря», — что указывает на узнаваемость этого имени в повседневной речи.

Суффикс -ев в фамилии Вахрушев указывает на принадлежность: потомок человека по имени Вахруша. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на мягкий согласный или -а: Вахруша → Вахрушев. Интересно, что в некоторых говорах форма Вахруша могла закрепиться и как прозвище — например, для человека с особенным говором или повадкой, но основное происхождение всё же связано с именем.

Фамилия Вахрушев встречается в основном в северных и центральных регионах России: в Вятской, Пермской, Архангельской губерниях. Это подтверждает, что Варфоломей и его производные были особенно распространены среди северного крестьянства. Встречаются и однокоренные фамилии: Вахрамеев, Вахрушин — все они восходят к тому же источнику, но различаются суффиксами и местными произносительными нормами. Если Вахрушев — это «сын Вахруши», то Вахрушин мог возникнуть из формы Вахруша с другим суффиксом или из женского имени Вахруша.