Фамилия Вахрущев принадлежит к распространённому типу русских фамилий, образованных от полных форм крестильных имён. Её основа — каноническое имя Варфоломей (арамейское «сын вспаханной земли», «сын Птоломея»). В русском обиходе длинное имя быстро сокращалось и обрастало народными формами: Вахрамей, Вахруш, Вахруша. От последнего, Вахруш, и пошла фамилия. Суффикс -ев присоединялся к основам на мягкий согласный или шипящий, что в данном случае закономерно: Вахруш + ев.

Словообразовательная модель проста: Вахруш — уменьшительно-ласкательное или обиходное прозвище человека по имени Варфоломей. Суффикс -ев (вместо более частого -ов) указывает на то, что основа оканчивалась на шипящий звук «ш». Это типично для северных и центральных говоров, где формы вроде Вахруш, Федюш, Илюш были особенно употребительны. Таким образом, Вахрущев буквально означает «сын Вахруша», то есть потомок человека, которого в быту звали Вахрушей.

В ономастических словарях, в частности в работе Б. Унбегауна «Русские фамилии», форма Вахрушев (через -ев) рассматривается как вариант, образованный от той же основы, что и более редкая Вахрушов. Разница лишь в ударении и диалектной огласовке. Вахрущев — это та же фамилия, но с чередованием ш/щ, которое могло возникнуть под влиянием местного произношения или при записи в документах (так называемое «цоканье» или «щоканье» иногда давало формы типа Вахруща).

С точки зрения социального контекста, фамилия Вахрущев не указывает на дворянское происхождение. Это типичная «отчество» крестьянского или посадского сословия, закрепившееся в XV–XVII веках. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, причём в основе лежало не прозвище по профессии или внешности, а личное имя. Географически фамилия чаще встречается в северных областях России (Архангельская, Вологодская, Кировская) — именно там народные формы от Варфоломея, вроде Вахруш, были особенно живучи.

Стоит отметить, что корень «вахр» иногда ошибочно связывают с тюркскими или финскими заимствованиями, но это ложный след. Все версии сходятся к одному: перед нами русифицированная форма древнееврейского имени Варфоломей, прошедшая через горнило народной этимологии.