Фамилия Ваккулина — женская форма, образованная от мужской Ваккулин. В основе лежит либо прозвище, либо, что вероятнее, церковное имя Ваккул. Это имя встречается в святцах: Ваккул (или Вакул) — краткая форма от латинского Baculus, что значит «палка», «посох». В православной традиции известен мученик Ваккул, пострадавший за веру в III веке. В народном обиходе имя часто упрощалось до Вакула — именно такая форма знакома читателям гоголевской «Ночи перед Рождеством».

Суффикс -ин указывает на модель образования от имён или прозвищ, оканчивающихся на -а, -я. Ваккулин, соответственно, означает «сын Ваккулы» или «человек из рода Ваккулы». В русской ономастике фамилии на -ин широко распространены в северных и центральных регионах, тогда как на юге и в Поволжье чаще встречается -ов/-ев. Поэтому Ваккулина — типичная фамилия для северорусского ареала, хотя конкретная география её бытования узкая.

Редкость фамилии объясняется не только нечастым именем, но и историей бытования. Ваккул — имя не из популярных, в отличие от Ивана или Петра. Соответственно, и фамилий от него образовалось мало. Встречается она преимущественно в Вологодской и Архангельской областях, где сохранились старые северные говоры и имена. В современных справочниках фамилия Ваккулин (и Ваккулина) фиксируется как редкая, с единичными носителями.

Есть и другой, менее вероятный вариант: от прозвища Ваккула, которое могло быть связано со словом «ваккать» — в некоторых говорах так называли крик, плач или звук, похожий на воронье карканье. Но это лишь гипотеза без серьёзной опоры в источниках. Основная версия — от крестильного имени Ваккул — надёжнее и подкреплена церковной традицией.

Таким образом, фамилия Ваккулина — это след имени, которое когда-то носил предок, возможно, крестьянин или священнослужитель из северных земель. Сегодня она остаётся напоминанием о старом, почти забытом антропониме.