Основой фамилии Вакулин послужило мирское имя Вакула. Согласно другой, более правдоподобной версии, эта фамилия образована от украинского имени Вакула, которое восходит к крестильному мужскому имени Вукол (в переводе с греческого – «пастух»). Веселовского записан Бакула, крестьянин, 1495 г., Новгород. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Вакула, со временем получил фамилию Вакулин.