Фамилия Ваксин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Ваксин образована от прозвища Вакса, которое восходит к аналогичному нарицательному, имеющему значение «состав из сажи, для чернения и лощения кожи, обуви». Так, предок обладателя фамилии Ваксин мог заниматься изготовлением или чисткой обуви. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Вакса, со временем получил фамилию Ваксин. О точном месте и времени возникновения фамилии Ваксин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Ваксин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.