Фамилия Вакунов образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Вакунов образована от прозвища Вакун, которое восходит к украинскому слову «вакувати» - «оставаться необработанным (о земле); быть незаполненным; не использоваться»; «расточать, тратить попусту время». Согласно этому, можно предположить, что основатель рода Вакуновых был нерадивым крестьянином, который не возделывал землю. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Вакун, со временем получил фамилию Вакунов. О точном месте и времени возникновения фамилии Вакунов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Вакунов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.