Фамилия Ванишева восходит к каноническому мужскому личному имени Иоанн (в переводе с древнееврейского означает «милость Божья»). В основе фамилии лежит просторечная форма этого имени – Ваниш. Скорее всего, основатель рода Ванишевых был выходцем из рабочей или крестьянской среды.