Фамилия Ванягина образована от имени Ваняга — народной, разговорной формы имени Иван. Каноническая форма этого имени — Иоанн, а в переводе с древнееврейского оно означает «милость Божья». У славян фамилии, возникшие от производных форм имени Иван, встречаются повсеместно: с XVI по XIX век это имя было самым распространённым у восточных славян, поскольку в святцах числится более ста святых покровителей. Поэтому Ванягины — одна из множества фамилий, корень которых уходит в это «народное» имя.

Обратим внимание на суффикс. Фамилия Ванягина образована по модели «-ин», что типично для русского Севера и ряда центральных областей. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — Ванягин, то есть сын или потомок Ваняги. В отличие от фамилий на «-ов», которые чаще встречаются в южных и восточных регионах, «-ин» характерен для территорий, где в обиходе были краткие притяжательные прилагательные. Само имя Ваняга — не полное, а именно краткая, обиходная форма, что говорит о простом, неаристократическом происхождении основателя рода. В среде крестьян и посадских людей такие «домашние» имена были нормой, и именно они ложились в основу фамилий.

Вероятно, предок Ванягиных не принадлежал к высшим сословиям. На Руси полные церковные имена (Иван, Иоанн) давали при крещении, а в быту использовали уменьшительные или просторечные варианты — Ваня, Ванюта, Ваняга. Когда в XVIII–XIX веках фамилии начали закрепляться официально, за многими крестьянскими и мещанскими родами записали именно такие «уличные» прозвища. Так потомок человека по имени Ваняга со временем получил фамилию Ванягин, а женщина — Ванягина.

Интересно, что фамилия Ванягина встречается относительно редко. В отличие от массовых Ивановых или Ваниных, форма с суффиксом «-яга» (Ваняга) менее типична для центральных губерний и чаще фиксируется в северных и северо-западных регионах России. Это дополнительный штрих, позволяющий предположить, что географические корни рода — где-то в районе Архангельской, Вологодской или Новгородской земли, где такие словообразовательные варианты были в ходу.