Фамилия Варкентин — редкая и неочевидная для русского слуха. Её происхождение, скорее всего, не славянское, а балтийское. Наиболее вероятная версия связывает основу фамилии с литовскими словами: vaar («истинный», «постоянный», «старый») и kunde («завсегдатай», «клиент»). Из них сложилось прозвище Варкенде — так могли назвать человека, который был постоянным посетителем какого-либо заведения или частым гостем в доме. Со временем прозвище закрепилось за потомками в форме Варкентин.

С точки зрения словообразования, фамилия необычна для русской традиции. В ней нет типичных русских суффиксов (-ов, -ев, -ин, -ский). Окончание -ин здесь не является русским патронимическим суффиксом (как в «Петров» или «Ильин»), а, вероятно, входит в основу литовского происхождения. Это указывает на то, что фамилия могла быть записана в документах без адаптации, в том виде, в каком её произносили носители балтийского говора. Подобные случаи встречаются в западных регионах бывшей Российской империи, где литовские, польские и белорусские фамилии соседствовали и смешивались.

Географически фамилия Варкентин встречается крайне редко. Основные следы ведут в Литву и на северо-запад современной России, в частности в Калининградскую область. В советское время носители фамилии могли переселиться в другие регионы, но исходный ареал остаётся балтийским.

Если рассматривать альтернативные версии, то связь с немецкими корнями маловероятна: в немецком нет сочетания Warkentin, которое давало бы осмысленное значение. Попытки вывести фамилию из славянского «варкать» (говорить невнятно) или «вар» (кипяток) не выдерживают критики — они не объясняют окончание -ентин, которое явно не славянское. Поэтому версия с литовским vaar и kunde остаётся самой обоснованной.

Таким образом, предок носителя фамилии Варкентин с большой вероятностью был литовцем или жителем балтийского региона, которого окружающие запомнили как завсегдатая — постоянного гостя или клиента. Фамилия сохранила эту характеристику в почти неизменном виде, пройдя через века и границы.