По одной из версий, фамилия Ватанен является искусственной и происходит от финского слова vattu - «малина». Однако нельзя исключить, что в основе этой фамилии лежит прозвище Вата, образованное от слова vatja - «водский». В таком случае основатель рода Ватанен мог быть представителем народности водь, проживающей ныне в Кингисеппском районе Ленинградской области. Также весьма характерным для финских фамилий является элемент –лайнен/–ляйнен: этот суффикс означает «похожий на что-либо, подобный чему-либо» или же «принадлежащий какой-либо народности», «происходящий из какой-либо местности».