Фамилия Ваткина — женская форма, но разбирать её логичнее через мужской вариант Ваткин. В основе лежит прозвище или мирское имя Ватка. Сразу отсекаем прямую связь с ватой: в русских говорах слово «ватка» не значило ни материал, ни ватный предмет. Скорее всего, это уменьшительно-ласкательная форма от крестильного имени Ват — а оно, в свою очередь, усечение от Ватолий или Ваталий (редкие варианты Анатолия). Такие сокращения (Ват, Вата, Ватка) встречались в северных и центральных губерниях, где любили «домашние» имена, непохожие на полное церковное.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Ваткин — «сын Ватки». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Географически фамилия Ваткин (и Ваткина) чаще всего встречается в Пермском крае, Кировской области и Удмуртии. В этих местах в XVII–XVIII веках активно селили крестьян из центральных уездов, и там хорошо сохранились старые прозвищные формы.

Есть и альтернативная версия — от диалектного слова «ватка» в значении «кусок, лоскут, обрывок». В некоторых северных говорах так называли небрежно оторванный клок ткани. Прозвище Ватка могли дать неряшливому человеку или, наоборот, портному, который работал с лоскутами. Но эта гипотеза менее вероятна: прозвища от «рванины» обычно давали с явной отрицательной окраской, а такие фамилии в массе не выживали — их старались сменить.

Сословная принадлежность носителей фамилии — почти наверняка крестьянская или мещанская. Дворянских родов Ваткиных в гербовниках нет. Фамилия нередкая, но и не массовая: в списках однодворцев и государственных крестьян XVIII–XIX веков она встречается эпизодически. Если у вас есть предки с этой фамилией из Вятки или Прикамья, скорее всего, они были хлебопашцами или ремесленниками, а имя Ватка передалось через несколько поколений как фамильное прозвище.