Фамилия Ватрушкин — это типичный пример «вкусной» русской фамилии, образованной от прозвища, связанного с едой. В основе лежит слово «ватрушка» — открытая лепёшка с творогом или вареньем, хорошо известное блюдо русской кухни. Прозвище Ватрушка могли дать по профессии: пекарю, кондитеру или торговцу мучными изделиями. Но не стоит думать, что все Ватрушкины — потомки булочников. В народе прозвища часто давали по любимому блюду — лакомку, который не мог пройти мимо ватрушки, вполне могли так окрестить. Есть и третья версия: в говорах полного, круглого человека тоже могли в шутку назвать Ватрушкой — по сходству с пышной лепёшкой.

Фамилия образована по стандартной модели: к основе «Ватрушк-» добавили суффикс принадлежности «-ин». Суффикс «-ин» в русских фамилиях указывает на «чей?» — то есть «сын Ватрушки». Это одна из самых распространённых моделей в центральной России и Поволжье. Среди однокоренных фамилий — Ватрушкин, Ватрушков, Ватрушев, но именно форма на «-ин» встречается чаще.

Интересна география фамилии. Хотя ватрушки — блюдо общерусское, фамилия Ватрушкин имеет заметную привязку к Поволжью. В Книге памяти Республики Татарстан упоминается Ватрушкин Василий Тимофеевич, 1887 года рождения, из деревни Ильинское Зеленодольского района. Это не единичный случай: в метрических книгах Казанской и Симбирской губерний фамилия встречается регулярно, что может говорить о компактном проживании носителей в этом регионе.

Разбирая словообразовательную модель, стоит обратить внимание на суффикс «-к-» в основе «ватрушк-». В русском языке этот суффикс часто придаёт слову уменьшительно-ласкательный или бытовой оттенок. То есть прозвище Ватрушка звучало не грубо, а скорее уютно, по-домашнему. Это косвенно подтверждает, что прозвище могли дать не только за профессию, но и за характер или привычку.