Фамилия Вайткуне — редкий для России случай, когда фамилия не просто имеет иноязычные корни, а сохранила форму, типичную для литовского женского рода. В русском языке фамилии почти всегда заканчиваются на -ов, -ин или -ский, но Вайткуне стоит особняком: окончание -е выдает в ней литвинизированную форму, а точнее — фамилию литовской женщины, записанную по правилам литовской грамматики.

Основа фамилии — литовское слово «vaitkus» или «vaitkutis». В литовском языке это уменьшительно-ласкательная форма от имени Вайткас (Vaitkas), которое, в свою очередь, происходит от крестильного имени Вайткус — литовского варианта славянского имени Войтех (Vojtěch). Имя Войтех (в польской версии — Войцех) означает «утешение войска» или «тот, кто утешает воинов». Таким образом, Вайткуне в буквальном смысле — «дочка маленького Вайткаса» или «женщина из рода Вайткусов».

Ключевая особенность: в литовском языке суффикс -уне (-ūnė) указывает на незамужнюю женщину или дочь. То есть Вайткуне — это именно женская форма фамилии. Если бы речь шла о мужчине, фамилия звучала бы как Вайткус (Vaitkus) — одна из самых распространенных литовских фамилий. Встречается вариант Вайткутис (Vaitkutis) — уже с другим суффиксом, но с тем же корнем.

В Беларуси и на северо-западе России (Псковская, Смоленская области, Калининград) такая фамилия могла появиться в результате многовековых литовско-польских контактов. Носительница фамилии Вайткуне в XIX — начале XX века, скорее всего, была литовкой или белоруской из католических семей, где имя Войтех было популярно. В метрических книгах женские фамилии могли записывать именно в такой форме, не русифицируя окончание.

Сегодня фамилия Вайткуне крайне редка за пределами Литвы. В России она почти не встречается — единичные случаи связаны либо с замужеством за литовцем, либо с сохранением девичьей фамилии в документах. Если вы носите эту фамилию, скорее всего, ваши предки происходят из исторической Литвы или приграничных с ней регионов, где литовская речь и католическая традиция сохранялись даже в советское время.