Фамилия Вернерова — это женская форма, а её основа, мужская фамилия Вернер, имеет немецкие корни. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от славянских имен и прозвищ, Вернер восходит к немецкому личному имени Werner. Оно, в свою очередь, происходит от древневерхненемецких слов «wari» (защита, охрана) и «heri» (войско). Таким образом, имя Вернер означало «защитник войска» или «воин-хранитель». В Россию фамилия попала вместе с немецкими переселенцами, ремесленниками, офицерами и специалистами, которых приглашали на службу, начиная с петровских времен и особенно активно в XVIII–XIX веках.

Фамилия Вернерова, как и её мужской вариант, — относительно редкая для исконно русской среды. Она указывает на то, что предок носителя был либо этническим немцем, либо человеком, получившим фамилию по месту жительства или по прозвищу, связанному с немцами (например, в деревнях могли прозвать «Вернером» за схожесть с приезжим). Женская форма на -ова появилась позже, по русской традиции: дочь или жена Вернера становилась Вернеровой. Такая модель типична для фамилий, заимствованных из западноевропейских языков, где окончание адаптировали под русскую грамматику.

Интересная деталь: в немецком языке фамилия Werner не склоняется, а в русском обросла суффиксом -ов, который в данном случае не указывает на принадлежность к роду (как в «Иванов»), а просто русифицирует звучание. Встречаются также варианты Вернер (без суффикса) и Вернеров (с мужским окончанием). Географически фамилия распространена там, где исторически проживали немецкие колонисты: Поволжье, Санкт-Петербургская губерния, юг Украины, а также в крупных городах, куда в советское время переезжали специалисты немецкого происхождения.

Поскольку фамилия не славянская, её носители в России — это потомки тех, кто либо сохранил немецкое имя предка, либо получил фамилию в результате брака с немецкоязычными переселенцами. В дворянских родословных книгах фамилия встречается редко: чаще всего Вернеры были мещанами, купцами, врачами, инженерами или военными. Одно из немногих упоминаний в исторических источниках — это род Вернеров, внесённый в родословные книги дворян Царства Польского, что подтверждает западное происхождение.