Фамилия Виканова — женская форма мужской фамилии Виканов, и её происхождение связано с редкой словообразовательной моделью. В русских фамилиях суффикс -анов встречается гораздо реже, чем -ов или -ин. Он указывает на принадлежность к человеку, чьё имя или прозвище заканчивалось на -ан: Викан → Виканов. То есть предок носителя фамилии был сыном или потомком человека по имени или прозвищу Викан.

Самая вероятная основа — каноническое имя Виктор. В народной речи Виктор мог сокращаться до Вика, а затем приобретать уменьшительно-ласкательный суффикс -ан: Викан. Такой способ образования прозвищ и неофициальных имён был распространён в русской деревне: от Виктор — Викан, от Михаил — Михан, от Павел — Паван. Если принять эту версию, фамилия Виканов означает «потомок Викана», то есть человека, которого в быту звали уменьшительным именем от Виктора.

Вторая гипотеза менее надёжна, но её стоит упомянуть. В некоторых говорах «викать» означало кричать, издавать резкий звук, а «викан» могло быть прозвищем крикливого или голосистого человека. Однако для фамилий, образованных от глаголов, чаще использовались суффиксы -л- или -к- (Викало, Викалка), а -ан типичен именно для имён и прозвищ-характеристик. Поэтому версия с именем Виктор выглядит убедительнее.

Географически фамилия Виканов (и Виканова) встречается редко, в основном в центральных и северных областях России — там, где были сильны традиции бытовых уменьшительных имён. В документах XVII–XVIII веков она не зафиксирована, что говорит о её относительно позднем оформлении: скорее всего, фамилия сложилась в XIX веке, когда крестьянам массово присваивали фамилии по отчеству или прозвищу.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Викторов, Викторович, Викулов — показывает, что Виканов стоит в одном ряду с менее официальными формами. Если Викторов прямо указывает на имя Виктор, то Виканов — на его народную, «домашнюю» версию. Такие фамилии часто носили люди, чьи предки не имели фамилий по сословной принадлежности и получали их по прозвищу, данному в семье или на улице.