Фамилия Виндерский — редкая и неочевидная. Её звучание наводит на мысль о немецких или еврейских корнях, но на деле она почти наверняка русская, польская или украинская по происхождению. Главная подсказка — суффикс -ский. В восточнославянской традиции этот суффикс чаще всего указывает на дворянское или шляхетское происхождение, либо на географическую привязку: фамилию давали по названию поместья, села или усадьбы.

Основа «Виндер-» в русском языке не имеет прямого значения. Однако она легко сопоставляется с польским словом winda (лифт, подъёмник) или немецким Wind (ветер). В польской ономастике встречаются фамилии Виндер, Виндзерский, Виндерский — их могли получить люди, жившие в местности, называвшейся Винда или Виндеры. Такие топонимы существовали на территории бывшей Речи Посполитой (современные Польша, Западная Украина, Беларусь). Вероятнее всего, предок носителя фамилии был шляхтичем или крестьянином, переселившимся из села с названием вроде Виндеры или Винджево.

Есть и менее вероятная, но допустимая версия — искусственное происхождение. В XIX веке семинаристы иногда получали фамилии по латинским или немецким корням. Vindico (лат. «защищаю») могло дать Виндерский, но это редкий случай, и прямых подтверждений в словарях нет.

Если отбросить экзотику, то Виндерский — типичная «географическая» фамилия, образованная по модели «название места + -ский». Её носители, скорее всего, происходят из западнорусских или польских земель, где такие топонимы были распространены, но со временем исчезли из употребления.