Фамилия Винько звучит для русского уха необычно, и это понятно: она пришла с Украины или из Беларуси. Её основа — слово «винь» или «вин», которое в юго-западных говорах означало «он». Сравните с польским «on» или украинским «він». Суффикс -к-о — типичный для украинских и белорусских фамилий, он образует прозвища и семейные именования (как Шевченко, Коваленко). Получается, что Винько — это буквально «он», «тот самый», «этот человек». В старину так могли прозвать единственного сына в семье, позднего ребёнка или человека, который постоянно вставлял в речь слово «він» — вроде речевого паразита.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с уменьшительной формой имени Винценты или Викентий (в польской традиции — Wincenty). В этом случае Винько — аналог русского Винька или Винюша, то есть «сын Винцентия». Однако на украинских землях форма с суффиксом -к-о чаще относилась к прозвищам, чем к крестильным именам.

По сословию фамилия не даёт подсказки: Винько могли носить и казаки, и крестьяне, и мещане. Географически она встречается в основном в западных областях Украины (Волынь, Подолье) и на юго-востоке Польши. В России фамилия редкая, её носители — потомки переселенцев с Украины конца XIX — начала XX века.

Сравните с однокоренными фамилиями: Виняр, Винярский (от польского «winiarz» — виноградарь) и Виньковский (с русским суффиксом -овск-). Винько стоит особняком — без ремесленной или географической привязки, чисто прозвищная фамилия, построенная на местоимении.