Фамилия Водяной образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Водяной послужило мирское имя Водяной. Фамилия Водяной относится к числу так называемых «водных» фамилий. Возможно, она образована от топонима: предок обладателя этой фамилии мог жить неку от водоема, за что и получил прозвище Водяной. Согласно другой, более правдоподобной версии, фамилия образована от нецерковного имени Водяной, которое считалось «охранным». В данном случае, надеясь иметь красивого и здорового мальчика, родители назвали его Водяной. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Водяной, со временем получил фамилию Водяной. О точном месте и времени возникновения фамилии Водяной в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Водяной представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.