Фамилия Воиткова — женская форма, а её мужской вариант — Воитков. В основе лежит имя или прозвище Воитко. Это уменьшительная форма от канонического имени Войтех (чешское Vojtěch) или от древнерусского нецерковного имени Войт. Разберём оба варианта.

Имя Войтех пришло на Русь через западнославянское влияние, особенно активно — через Польшу и Белоруссию. В переводе с древнечешского Vojtěch значит «утешение войска» или «радость воинов». Имя было популярно у католических святых, но в православной среде встречалось реже, чаще в виде прозвища или мирского имени. Уменьшительный суффикс -ко (Воитко) характерен для украинской, белорусской и южнорусской традиции: так образовывали ласковые или обиходные формы имён (Иван — Иванко, Пётр — Петько). Фамилия на -ов/-ова указывает на принадлежность: Воитков буквально «сын Воитка».

Вторая версия — от прозвища Войт. В польских и западнорусских землях войтом называли выборного старосту, главу сельской общины или городского магистрата (от нем. Vogt — управляющий, наместник). Человек, носивший прозвище Войт, мог быть либо потомком такого старосты, либо сам занимать эту должность. Тогда Воитко — уменьшительное от Войт, а фамилия указывает на социальный статус предка.

Географически фамилия Воитков/Воиткова тяготеет к западным и юго-западным регионам: Брянская, Смоленская области, Белоруссия, Украина. Встречается она нечасто, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска — если ваши предки носили эту фамилию, скорее всего, их корни из западнорусских или белорусских земель.