Фамилия Вологжанинов происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Вологжанинов образована от прозвища Вологжан. Вологжанином (а также воложанином, вологодчанином и вологодцем) называют жителя Вологды, русского города, известного с XIII века. Таким образом, это прозвище указывает на место жительства предка обладателя фамилии Вологжанинов. Есть еще одна гипотеза, по которой город назван в честь реки Вологда (на финно-угорском «чистая вода»). О точном месте и времени возникновения фамилии Вологжанинов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Вологжанинов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.