Фамилия Волохова хранит память о прозвище дальнего предка. Скорее всего, в основе лежит слово «волох» — так на Руси называли румын и молдаван. Волохом могли прозвать пришлого выходца из этих земель или человека, долго жившего среди них. Встречается и другая версия, менее вероятная: связь со словом «волхв», то есть жрец, знахарь, предсказатель. Волхвы в старину занимались врачеванием, гаданием, охраняли скот и посевы от бед. Однако именно этническое прозвище выглядит убедительнее благодаря историческим документам: в источниках XVI века упоминаются князь Владимир Дмитриевич Волох Бычков-Ростовский, Волох Суседов (1519 год) и воевода Залешенин Никифорович Волохов (1583 год, Двина). Эти записи подтверждают, что прозвище Волох бытовало в разных слоях общества — от князей до служилых людей.

Существует и третья, совсем слабая гипотеза: будто фамилия восходит к уменьшительной форме имени Владимир — Волоша. Но народная этимология, связывающая «Владимир» с «владеющий миром», не объясняет, почему основой стала именно редкая уменьшительная форма, а не, скажем, Володя или Вова. К тому же документальных подтверждений этой версии нет, в отличие от случаев с реальными Волохами. Поэтому основная версия — прозвище по национальности или, реже, по занятию волхва.

Фамилия Волохова образована по стандартной русской модели: к основе Волох добавили суффикс -ов (в женском роде — -ова), что означает «принадлежащий Волоху», то есть потомок этого человека. Известно, что кормилица царевича Дмитрия носила именно эту фамилию — исторический факт, который связывает род Волоховых с событиями Смутного времени. Таким образом, фамилия Волохова — не просто семейное имя, а прямой указатель на прозвище предка, будь то выходец из румынских земель или знахарь-волхв.