Фамилия Вовковинская — женская форма от Вовковинский, и её разбор стоит начать с суффикса. Окончание -ский (в женском роде -ская) указывает на типично польский или западнорусский (шляхетский) способ образования фамилий. Такие фамилии часто давались по названию имения, усадьбы или местечка: владелец чего-то становился «Вовковинским», то есть «из Вовковин» или «относящийся к Вовковину». Сама основа «Вовков-» почти наверняка восходит к имени или прозвищу Вовк — это украинская, белорусская и польская форма слова «волк». В славянских языках корень «волк»/«вовк» был распространён в прозвищах: Вовком могли назвать человека хищного, одинокого, либо, наоборот, того, кто жил в лесу и промышлял охотой.

Таким образом, фамилия образовалась по цепочке: прозвище Вовк (или уменьшительное Вовко) → притяжательное прилагательное Вовков (чей? — Вовков сын) → топоним Вовковино или Вовковина (населённый пункт, где жили потомки Вовка) → фамилия Вовковинский (указание на выходца из этого места). Географически такие фамилии тяготеют к западу бывшей Российской империи: Волынь, Подолье, Гродненщина, а также к восточным землям Речи Посполитой. В современной России носители фамилии встречаются редко, чаще — в Беларуси и на Украине.

Интересная деталь: в русской традиции фамилии на -ский обычно закреплялись за дворянством и духовенством, но в Польше и на западнорусских землях они были массовыми у мелкой шляхты. Вовковинские могли быть небогатыми землевладельцами или служилыми людьми, получившими фамилию по месту службы или владения. Вторая версия, менее вероятная, — что основа «Вовков-» происходит не от прозвища, а от названия села Вовков (такие есть в Беларуси и Польше), и тогда фамилия — чисто топонимическая, без зооморфного подтекста.

Отдельно стоит сказать о написании: двойное «в» в корне (Вовковинская) не случайно. Первое «в» входит в корень «вовк», второе — суффикс притяжательности -ов-. Это не опечатка и не вариант фамилии Вовкинская (от Вовка). Если бы фамилия звучала как Вовкинская, она означала бы «принадлежащий Вовке», но здесь — «относящийся к Вовкову». Вариант с одним «в» (Воковинская) — искажение, возникшее при неграмотном произношении или записи.