Фамилия Вовковская — женская форма на -ская, указывающая на происхождение от географического названия, но с заметной редкостью: в отличие от массовых Волковских, здесь в основе лежит не «волк», а форма «Вовк». Это украинская, белорусская или южнорусская фамилия, где «вовк» — то же, что «волк». Так что Вовковская — это, по сути, та же Волковская, но с местным произношением.

Корень «вовк» в восточнославянских говорах — обычное слово для волка, закрепившееся в прозвищах. Предка человека с такой фамилией могли прозвать Вовком за характер, внешность или род занятий — например, за охоту на волков или за то, что жил в глухом лесу. От этого прозвища образовали фамилию Вовков (или Вовко), а уже от неё, по модели владельческих фамилий, — Вовковская: «из рода Вовковых» или «принадлежащий Вовку».

Суффикс -ская типичен для польской и западнорусской шляхты, а также для фамилий, образованных от названий усадеб и деревень. Возможно, существовало селение Вовково или Вовки, и его жительница или владелица получила фамилию по месту. В этом случае Вовковская — не просто «дочь Вовка», а указание на выходца из конкретного населённого пункта. Такие фамилии чаще встречались среди духовенства и дворянства, но могли закрепиться и у крестьян после отмены крепостного права, когда фамилии давали по названию деревни.

Интересно, что фамилия Вовковская — почти зеркальное отражение фамилии Волковская, но с явным украинским или белорусским акцентом. В документах XIX века её могли записывать по-разному: Вовковская, Волковская, иногда даже Вавковская — из-за нестабильности произношения гласных в говорах. Встречается она редко, сосредоточена в основном на западе России, в Беларуси и на Украине. Если ваши предки носили эту фамилию, скорее всего, они жили в зоне смешения языков — на границе великорусских и малорусских земель.