Фамилия Войников образована от прозвища Войник, в основе которого лежит нарицательное «воин». Так, предок обладателя фамилии Войников был военным деятелем. Согласно другой версии, фамилия восходит к личному имени Войник. Иные малограмотные священники по ошибке нарекали младенца не именем святого, а его прозванием; так и появились люди с официальным именем Воин, Войнал, Войник и др. Так и прозвище Войник закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Войников. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Войник, со временем получил фамилию Войников.