Фамилия Вожжовы образована от прозвища Вожжа, а оно — от слова «вожжа». В словаре Владимира Даля вожжа определяется как верёвка, которой управляют запряжённой лошадью: её пристёгивают к удилам пряжкой или кляпом. Прозвище Вожжа, скорее всего, давали извозчику или мастеру, который делал конскую упряжь. Такие именования по профессии — частый случай в славянской ономастике: человека называли по его делу, и это прозвище закреплялось за ним и его детьми.

Фамилия образована по стандартной модели: к основе Вожж- добавили суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Вожжов, то есть сын или потомок Вожжи). Суффикс -ов характерен для русских фамилий, возникших в центральных и северных регионах России. В южных и западных областях чаще встречается суффикс -енко, а в северных — -их/-ых, так что Вожжовы — типичный пример именно великорусской фамилии.

Слово «вожжа» живёт в русском языке не только как ремесленный термин, но и в поговорках. «Дом вести — не вожжой трясти» означало, что хозяйство требует не одной лишь команды, а толкового управления. «На ретивого коня не кнут, а вожжи» — про осторожность в обращении с горячим нравом. Такие выражения подтверждают, что вожжа была привычной деталью крестьянского и ямщицкого быта, а прозвище Вожжа не казалось странным или редким.

Встречаются однокоренные фамилии: Вожжин, Вожжиков, Вожжов. Вариант Вожжовы — множественное число от Вожжов, которое в быту употребляют, говоря о всей семье или роде. В официальных документах фамилия чаще всего склоняется в единственном числе (Вожжов), но в устной традиции форма «Вожжовы» закрепилась как родовое имя.

Точное место и время возникновения фамилии Вожжовы установить без специальных архивных поисков невозможно. Прозвища, лёгшие в основу фамилий, бытовали повсеместно, и одинаковая фамилия могла независимо появиться в разных губерниях. Однако ясно, что корни её — в среде, тесно связанной с лошадьми и транспортом: ямщики, извозчики, шорники.