Фамилия Выгонова — женская форма от Выгонов, а та, в свою очередь, пошла от прозвища Выгон. В основе лежит нарицательное «выгон»: участок земли с травой, которую не косят, а прямо там скармливают скоту — подножный корм. Прозвище мог получить человек, который долго владел таким участком или пас на нём скот.

Образование фамилии типично для русского севера и центра: суффикс -ов указывал на принадлежность («чей?» — Выгонов сын). Постепенно это стало родовым именем, закрепилось за потомками. Интересно, что прозвище Выгон не обязательно означало владельца земли. В крестьянском быту до отмены крепостного права действовал пастбищный сервитут: крестьяне могли пасти скот на помещичьих землях, а помещики — на крестьянских. После реформы 1861 года эти сервитуты отменили, и пастьба на владельческих паровых полях и жнивье оказалась под запретом. Для многих крестьян это стало серьёзным ударом по хозяйству. Поэтому прозвище Выгон могло закрепиться за тем, кто особенно активно пользовался этим правом, спорил из-за выгонов или просто жил рядом с общим выгоном.

Другая, менее очевидная версия: прозвище могли дать по глаголу «выгонять» — например, пастуху, который выгонял стадо, или человеку с резким, «выгоняющим» характером. Но связь с земельным наделом выглядит правдоподобнее: в русских говорах слово «выгон» было обиходным, и фамилия Выгонов встречается в документах с XVII века, особенно в южнорусских и поволжских областях, где общинное землепользование было развито сильнее. Так что предки Выгоновых — скорее всего, крестьяне-землепользователи, чья жизнь была тесно связана с пастбищным укладом.